Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ITGB3BPQ13352 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGB3BPQ13352 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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