Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLAMF1Q13291 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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