Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms