Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NPRL3Q12980 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms