Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF2Q12947 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF2Q12947 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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