Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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