Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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