Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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