Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RASGEF1BQ0VAM2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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