Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EP300Q09472 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EP300Q09472 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms