Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms