Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
REG3AQ06141 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms