Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms