Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN12Q05209 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms