Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUCB1Q02818 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NUCB1Q02818 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms