Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms