Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms