Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PLCB3Q01970 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PLCB3Q01970 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms