Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms