Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POU5F1Q01860 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms