Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms