Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TFAMQ00059 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms