Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAD3P84022 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms