Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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