Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAD23AP54725 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAD23AP54725 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAD23AP54725 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAD23AP54725 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAD23AP54725 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAD23AP54725 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAD23AP54725 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAD23AP54725 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms