Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms