Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTDSS1P48651 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms