Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms