Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPARGP37231 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms