Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms