Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms