Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA10P31260 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms