Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CASP1P29466 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms