Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB3P28472 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms