Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLD1P28340 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLD1P28340 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLD1P28340 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLD1P28340 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms