Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR1BP28222 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR1BP28222 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms