Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USF1P22415 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
USF1P22415 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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