Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCKDHBP21953 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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