Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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HOXA5P20719 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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