Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM21P19474 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms