Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TSPAN8P19075 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPAN8P19075 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms