Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTRB1P17538 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTRB1P17538 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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