Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX4I1P13073 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms