Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RARBP10826 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RARBP10826 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RARBP10826 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RARBP10826 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms