Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IL3P08700 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3P08700 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3P08700 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3P08700 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3P08700 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3P08700 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3P08700 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3P08700 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms