Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAVP06756 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms