Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms