Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYBBP04839 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYBBP04839 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms