Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFP01375 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFP01375 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFP01375 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFP01375 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFP01375 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms