Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VIPP01282 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VIPP01282 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VIPP01282 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms